Metabolitos secundarios: El ajenjo contiene lactonas sesquiterpénicas del tipo guayanólido como absintina, artabsina, matrinica y anabsintina. Los componentes del aceite esencial son β-tuyona (1S,4R-tuyan-3-ona), acetato de transabinilo, cis-epoxiocimeno o acetato de crisantenilo. Mono y sesquiterpénos como α-tuyona (1S,4S-tuyan-3-ona) tuyano, tuyol, linalol, 1,8-cineol, β-bisabolol, α-curcumeno y espatulenol. Contiene grupos fenólicos como ácido cafeico y Taninos.